AF(オートフォーカス)のシステムにも違いがあります。EOS Kiss X9は、光学ファインダーでの撮影時は専用AFセンサーによる位相差検出AFが利用できます。測距点は9点、測距輝度範囲はEV-0.5~18に対応。ライブビュー撮影時はデュアルピクセルCMOS AFが作動し、こちらの測距点は49点、測距輝度範囲はEV-2~18に対応します。
いっぽうのEOS Kiss Mは、EOS Kiss X9よりも進化したデュアルピクセルCMOS AFを搭載しています。測距点は143点と非常に多く、センサー面の幅88%×高さ100%という広い範囲をカバーしています。さらに「瞳AF」やAFフレームサイズ「小」が選択できます。測距輝度範囲は同じくEV-2~18に対応。
AFの実際の使用感は、EOS Kiss X9の位相差検出AFが最も快適に感じました。特に、クロス測距に対応した中央の測距点を使った場合、薄暗いシーンや低コントラストな被写体、動きのある被写体に対してもスムーズに合焦します。
ただし、中央以外の測距点では合焦率がやや低下することや、全部でわずか9点しか測距点がない点は不満です。画面の端にピントを合わせる際は、シャッターボタンの半押しによるフォーカスロックが欠かせません。ライブビューに切り替えれば、デュアルピクセルCMOS AFによって49点の測距点が利用可能になります。
いっぽう、EOS Kiss MのデュアルピクセルCMOS AFは、低コントラストな被写体でAFが迷うケースも見られましたが、その点さえ気をつければAFの動作に大きなストレスはありません。顔+追尾優先AFや瞳AFも快適に作動しました。