2016年3月26日のダイヤ改正で、現在12往復設定されているL特急「スーパーカムイ」・快速「エアポート」の直通運転が取りやめに。「スーパーカムイ」は23往復すべて札幌~旭川間の運転となり、旭川駅では8時30分以降、上り列車が毎時0・30分発となる。
L特急「スーパーカムイ」の現在の使用車両は、1990年に登場した785系と、789系0番台をベースに札幌地区向けに製造され、2007年の「スーパーカムイ」デビューに合わせて投入された789系1000番台。ともに5両編成で運転され、指定席「uシート」は4号車に連結されている。789系1000番台は、特急「スーパー白鳥」に使用される0番台とは異なり、車体前面の貫通扉が設置されていない。
なお、札幌~室蘭間で運転されるL特急「すずらん」(東室蘭~室蘭間は普通列車)も、現在は785系・789系1000番台の共通運用となっている。