【別れ際に「I miss you.」と言われたときのアブナイ英語】Me too.
【こんな風に聞こえるかも】私も私がいないのは寂しいです(?)
【ネイティブが使う英語】I miss you too.

「I miss her」などの会話の場合は「Me too.」で間違いありませんが、目的語が「You」になった場合は、自分のことを指してしまいますので、返答に注意しなければいけないと覚えておきましょう。